Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms