Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms