Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCC1Q92922 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms