Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms