Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms