Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLIP4Q8N3C7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CLIP4Q8N3C7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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