Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPAP2Q8IXW5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms