Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC84Q86UT8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms