Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC141Q6ZP82 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC141Q6ZP82 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms