Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD1Q6UWL2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms