Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF544Q6NX49 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF544Q6NX49 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms