Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms