Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD40Q6AI12 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms