Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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