Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM78Q5T7P6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms