Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms