Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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