Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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