Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms