Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF13Q15543 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms