Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4BQ13620 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms