Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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