Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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