Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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