Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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