Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF3C1Q12789 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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