Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYBPC1Q00872 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYBPC1Q00872 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms