Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms