Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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