Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR4P46093 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR4P46093 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR4P46093 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR4P46093 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms