Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms