Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms