Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms