Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN2P35609 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms