Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms