Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms