Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2B1P20020 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2B1P20020 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms