Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD53P19397 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD53P19397 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD53P19397 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms