Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HLA-DOBP13765 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms