Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEFHP12036 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEFHP12036 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEFHP12036 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEFHP12036 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEFHP12036 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEFHP12036 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms