Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT3P12035 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT3P12035 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT3P12035 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms