Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms