Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC166P0CW27 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms