Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKAP2O75563 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms