Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms