Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM6AO15550 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms