Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PCH4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PCH4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PCH4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PCH4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PCH4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PCH4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PCH4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PCH4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PCH4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PCH4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms