Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATL2C9JE40 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms