Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN16Q9Y5I7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms