Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNRC6BQ9UPQ9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms